Lisaks kvaliteedikontrollile toimivad termopaarid kuumakanalisüsteemide peamise ohutusmehhanismina. Kontrollimatu ülekuumenemine võib kahjustada kütteseadmeid, sulatada teraskomponente või isegi tekitada tuleohtu. Termostaadid ja termokaitsmed pakuvad varukaitset, kuid termopaarid edastavad{2}}reaalajas andmeid, mis hoiavad ära ohtlikud tingimused enne nende tekkimist. Kaasaegsed kuumajooksu kontrollerid toetuvad termopaari tagasisidele, et käivitada häired, katkestada võimsus või sulgeda tsoonid, kui temperatuur ületab ohutuid piire.
Järelevalveta automatiseeritud tootmises muutub ohutus veelgi kriitilisemaks. Ebaõnnestunud või triiviv termopaar võib võimaldada pidevat kuumutamist, mis põhjustab küttekeha läbipõlemist, kollektori deformatsiooni või plasti leket. Kõrge täpsusega -termopaarid tuvastavad kiiresti ebatavalised tõusud, võimaldades kontrolleril reageerida mõne sekundi jooksul. Paljud tööstuslikud ohutusstandardid nõuavad survevaluseadmete usaldusväärset temperatuuriandurit, muutes termopaarid pigem vastavusnõudeks kui valikuliseks komponendiks.
Termopaarid kaitsevad operaatoreid ka hoolduse ajal. Täpsed temperatuurinäidud takistavad kokkupuudet ülekuumenenud düüside ja kollektoritega. Üleliigsete termopaaridega süsteemid kriitilistes tsoonides lisavad täiendava turvakihi. Stabiilse ja jälgitava temperatuuri tagamisega vähendavad kvaliteetsed-termopaarid õnnetuste ohtu, pikendavad seadmete kasutusiga ja säilitavad eeskirjade järgimise.
